Վարչապետի պաշտոնը սահմանվել է Հայաստանի Առաջին Հանրապետության հիմնադրման օրերից։
Հայաստանի առաջին վարչապետը 1918-1919 թվականներին եղել է Հովհաննես Քաջազնունին։
Խորհրդային Հայաստանում պաշտոնը վերանվանվել է «Ժողովրդական Կոմիսարների խորհրդի նախագահ», իսկ այնուհետև՝ «Մինիստրների Խորհրդի նախագահ»։
1991 թվականից գործադիր մարմնի ղեկավարը կրկին ստացել է պաշտոնի հին անվանումը՝ վարչապետ։
